Это имя образовано от греческого слова kosma, которое на русский язык переводится как «мир, порядок, мироздание» или «украшение». В основе данной фамилии лежит производная форма этого имени - Кузюня. Одним из святых покровителей имени Космы является преподобный Косма Маиумский. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Кузюня, со временем получил фамилию Кузюнин.