Фамилия Кузюнин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Кузюнин послужило церковное имя Косма. Это имя образовано от греческого слова kosma, которое на русский язык переводится как «мир, порядок, мироздание» или «украшение». В основе данной фамилии лежит производная форма этого имени - Кузюня. Одним из святых покровителей имени Космы является преподобный Косма Маиумский. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Кузюня, со временем получил фамилию Кузюнин. О точном месте и времени возникновения фамилии Кузюнин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Кузюнин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.