Фамилия Кузютин — одна из тех, что хранят память о личном имени предка, но не о крестильном, а о его домашней, обиходной форме. В основе лежит мужское имя Кузьма (от греческого «космос» — «устроитель мира», «порядок»). От него в русской народной среде образовали десятки уменьшительных вариантов: Кузя, Кузька, Кузюк, Кузюта. Последний и стал прямым источником фамилии.

Модель образования простая и типичная для восточнославянских фамилий: к основе Кузют- добавили суффикс принадлежности -ин. В древнерусском языке он отвечал на вопрос «чей?»: Кузютин сын, то есть сын Кузюты. Со временем притяжательное прилагательное закрепилось как родовое прозвище, а затем и как фамилия. Такая схема (основа на -а, суффикс -ин) характерна для имён, оканчивающихся на -а или -я: Кузюта → Кузютин, Илья → Ильин, Никита → Никитин.

Мирское имя Кузюта не было редкостью в северных и центральных губерниях России. В документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с этим прозвищем, но проследить непрерывную линию до современных Кузютиных почти невозможно. Фамилия не относится к числу массовых — её очаги расселения компактны: чаще всего она встречается в Вологодской, Архангельской областях и в Пермском крае, что косвенно указывает на возможное происхождение из Поморья или Приуралья.

Интересная деталь: в говорах Русского Севера слово «кузюта» могло иметь не только уменьшительное, но и шутливо-ласкательное значение — так называли невысокого, юркого человека. Однако основная версия всё же связывает фамилию с именем Кузьма, а прозвищный оттенок, если он и был, со временем стёрся.