Фамилия Кузютин образована от уменьшительной формы крестильного имени Кузьма (греч. — «устроитель мира»). В быту имя Кузьма часто сокращали, и на русской почве появились десятки ласковых и просторечных вариантов: Кузя, Кузька, Кузема, Кузюта. Именно последняя форма — Кузюта — и легла в основу фамилии.

Модель типична для восточнославянских фамилий: к основе Кузют- прибавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Кузюты). Такой способ образования — один из самых распространённых в России, но в сочетании с редкой основой Кузют- фамилия встречается нечасто.

В отличие от массовых Кузнецовых или Кузьминых, фамилия Кузютин сохранила более архаичную и локальную форму. Скорее всего, её носители происходят из регионов, где диалектное окончание -юта было в ходу: это могли быть северные или центральные губернии. В ономастических справочниках фамилия не упоминается как широко распространённая, что говорит о её относительно поздней фиксации и небольшом числе родов.

Интересно, что родственные фамилии — Кузютин, Кузюткин, Кузютов — образованы от одной и той же основы, но разными суффиксами. Вариант на -ин (Кузютин) — самый стандартный для русской антропонимии: он просто отвечает на вопрос «чей?». Если бы предка звали Кузюта, его сын в документах записывался как Кузютин — и так закрепилось.

Никаких следов сословной принадлежности или знатного происхождения у фамилии нет. Это типичная крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где мирские имена и прозвища свободно конкурировали с церковными. Кузюта — не каноническое имя, а народная переделка, что только подчёркивает живое отношение к имени в старину.