Фамилия Кыстауова звучит необычно для русского уха, и это прямой ключ к её происхождению. Это фамилия тюркская, скорее всего, казахская. Её основа — слово «кыстау» (в современной орфографии «қыстау»), которое в казахском языке означает «зимовка» или «зимнее пастбище». В традиционном кочевом хозяйстве казахов были сезонные стоянки: кыстау — место, где проводили зиму, обычно в долинах или у подножия гор, защищённое от ветров. Соответственно, прозвище Кыстау мог получить человек, который владел такой зимовкой, жил на ней постоянно или, возможно, родился там.

Суффикс «-ов» в конце фамилии — это русский патронимический формант, который добавили при оформлении фамилии в официальных документах, чаще всего в XIX–XX веках. В казахской среде фамилии часто русифицировали, присоединяя окончания -ов/-ев к тюркской основе. Форма Кыстауова — женская, мужской вариант будет Кыстауов. Таким образом, фамилия буквально означает «принадлежащий к зимовке» или «потомок того, кто связан с кыстау».

Географически фамилия тяготеет к Казахстану и прилегающим регионам России (Оренбургская, Астраханская области, Алтай). Встречается она нечасто, что делает её ярким маркером родовой памяти о кочевом прошлом. В отличие от распространённых русских фамилий, образованных от имён или профессий, Кыстауова несёт в себе не имя предка, а топографическую привязку к месту его зимней стоянки. Это редкий случай, когда фамилия прямо указывает на образ жизни — сезонное скотоводство. Если искать аналоги, то по смыслу она близка к русским фамилиям типа Зимников или Зимовцев.