Фамилия Лабутис — редкий для России случай литовской или жемайтийской фамилии, которая попала в русский обиход. Её основа — литовское слово «labas», что значит «добрый», «хороший». В современном литовском «labas» — это ещё и приветствие, но в основе фамилии лежит именно древнее значение: добрый человек, хороший парень.

Суффикс «-ис» (литовск. -is) — типичный для литовских фамилий мужского рода. Он соответствует русским окончаниям на согласный или на «-ов». То есть Лабутис — это «сын Лабутаса» или просто «Лабута». В Литве такие фамилии на -is носят в основном жемайты — жители западной части страны. Так что географически фамилия скорее всего происходит из Жемайтии или из исторических земель Великого княжества Литовского, граничащих с современной Беларусью.

В русской среде фамилия могла появиться двумя путями. Первый — через литовских переселенцев или ссыльных после восстаний XIX века. Второй — через белорусов, у которых литовские корни не редкость: в Беларуси фамилия Лабутис встречается чаще, чем в России, особенно в Гродненской и Витебской областях.

Интересно, что в литовском языке есть и фамилия Labutis — с ударением на второй слог. В русском написании ударение часто смещается на первый слог: Ла́бутис. Это типичная адаптация: русское ухо привыкло к ударению на корне, а не на окончании.

Родственных фамилий в славянских языках нет. Это не Добров или Добрынин, а именно балтский корень. Если искать параллели, то ближе всего будут литовские фамилии Лабутис, Лабутас, Лабуцкис — все они образованы от того же «labas». Встречается и вариант Лабутис с удвоенной «т» — Лабуттис, но это скорее ошибка записи в паспортах XIX века.

Сословно фамилия не привязана к дворянству. Скорее всего, Лабутисы были крестьянами или мещанами. В списках дворянских родов Российской империи эта фамилия не значится, а в метрических книгах XIX века встречается у литовских и белорусских крестьян.