Фамилия Лабыкин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от основы, оканчивающейся на -а, с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность — чей сын, чей потомок. Корень здесь — Лобык- (в диалектном произношении — Лабык-). В основе лежит прозвище, а не крестильное имя.

Прозвище Лобык (или Лабык) в русских говорах имело конкретное значение. В словарях русских народных говоров «лобык» (или «лабык») — это застенчивый, нерешительный, нерасторопный человек, иногда — простофиля. Слово происходит от глагола «лобаться» (обниматься, целоваться) в переносном значении — «умильно льнуть, ластиться», что со временем приобрело ироничный оттенок. Таким образом, первый носитель прозвища Лабык, скорее всего, получил его за мягкий, уступчивый или медлительный характер.

Встречается и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «лабык» — рыба бычок (в донских говорах). В этом случае прозвище могло быть дано за внешнее сходство (например, большая голова) или за особенности поведения. Однако семантика «нерешительного человека» для прозвищ более типична и лучше вписывается в ряд подобных фамилий (Тихонов, Скромников).

Фамилия Лабыкин — сравнительно редкая. Она не встречается в крупных дворянских родословных книгах, что указывает на её происхождение из крестьянской или мещанской среды. Географически она тяготеет к центральным и южнорусским областям, где было распространено слово «лобык» в указанном значении. В некоторых регионах фамилия могла писаться через «о» — Лобыкин, что отражает акающее произношение исходного слова.