Фамилия Ладышкина — женская форма фамилии Ладышкин, и её происхождение напрямую связано с мужской основой. В центре внимания здесь суффикс -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — «Ладышкин» значит «сын Ладышки» или «человек из семьи Ладышки». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я.

Сам корень — «Ладышк-» — вызывает главный вопрос: от какого слова он произошёл? Самый прямой путь ведёт к слову «лад» в значении «согласие, мир, порядок». В старину «ладой» или «ладушкой» ласково называли мужа или жену (сравните с песнями «Лада, лада моя»). Однако фамилия образована не напрямую от «лада», а от уменьшительно-ласкательной формы «Ладышка» — так могли в быту звать человека, который был миротворцем, желанным гостем, либо просто носителем имени Ладимир или Ладислав (редкие славянские имена с корнем «лад-»).

Менее популярная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «ладыш» — так в некоторых говорах называли глиняный горшок или кувшин (от «ладить» — делать, мастерить). В этом случае прозвище Ладышка мог получить гончар или ремесленник, работавший с посудой. Версия правдоподобна, но уступает первой по распространённости: фамилии от названий предметов быта встречаются реже, чем от личных имён и прозвищ по характеру.

Географически фамилия Ладышкин (и Ладышкина) тяготеет к центральным и северным регионам России, где корень «лад» в именах и прозвищах был особенно употребителен. Встречается она нечасто, что говорит о её относительно позднем оформлении или локальном бытовании. В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Кузнецов, Ладышкина сохраняет связь с конкретным прозвищем, которое в XVI–XVII веках могли дать человеку мирного нрава или, реже, мастеровому.