Фамилия Лафуткин — редкая, с затемнённым корнем, но её происхождение можно реконструировать через словообразовательную модель и соседние фамилии. Суффикс -кин однозначно указывает на русскую патронимическую основу: так образовывали фамилии от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (ср. Лафутка → Лафуткин). Вопрос в том, что такое «Лафутка».

Наиболее вероятная версия выводит основу из диалектного глагола лафутить или лафутничать — «бездельничать, шататься без дела» (зафиксировано в северных и сибирских говорах). Тогда Лафутка — прозвище ленивого или праздного человека. Это объяснение простое и вписывается в типичную для русских фамилий модель: прозвище по поведению → уменьшительная форма на -ка → фамилия. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным лафут в значении «лоскут, обрывок ткани» (тогда прозвище портного или оборванца), но эта лексема встречается реже.

В пользу версии о прозвище говорит и то, что фамилия не имеет аристократических суффиксов (-ский, -ич) и не связана с географическими названиями. Лафуткины — потомки крестьян или посадских людей, получивших фамилию по прозвищу предка. Географически фамилия встречается спорадически, без явного гнезда, но единичные записи XIX века есть в Вятской и Пермской губерниях — это косвенно подтверждает северное происхождение корня.

Написание фамилии устойчиво: Лафуткин (через «а»), варианты типа Лофуткин или Лафудкин не фиксируются. Это указывает на то, что прозвище произносилось с чётким «а» под ударением (ударение в фамилии, скорее всего, на второй слог — Лафу́ткин). Иных версий, связывающих фамилию с иноязычными корнями (например, французским «la foutre»), нет — это поздние и лингвистически несостоятельные домыслы.