Фамилия Лахтина образована от прозвища или имени Лахта с помощью патронимического суффикса -ин, который в русской традиции указывал на принадлежность («чей?» — сын Лахты). Со временем форма закрепилась как наследственная фамилия.

У фамилии две основные версии происхождения. Первая связывает её с нарицательным «лахта» — так в северных русских говорах называли небольшой морской залив или бухту. Слово заимствовано из финского языка, что неудивительно для территорий, где веками соседствовали русские и финно-угорские народы. В этом случае прозвище Лахта давали человеку, жившему на берегу такого залива. Вторая версия ведёт происхождение от крестильного имени Галактион (греч. «молочный»). В народной речи это имя сокращалось до Лактион, затем до Лахтион и, наконец, до Лахта. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая — топонимическая — выглядит предпочтительнее: фамилия Лахтиных особенно распространена на Русском Севере и в Приладожье, где топонимов с корнем «лахт-» (Лахта, Лахтинский) десятки.

Независимо от того, какой из двух путей верен, фамилия сохранила память о предке — либо о его месте жительства, либо о личном имени. Типичный суффикс -ин говорит о том, что основатель рода относился к непривилегированным сословиям: именно так, через притяжательную форму, оформляли фамилии крестьяне и горожане центральной и северной России.