Фамилия Лахтюк образовалась от прозвища или нецерковного имени Лахта. Точное происхождение основы спорно, и у лингвистов есть две основные версии.

Первая версия связывает прозвище Лахта с нарицательным словом «лахта». В словаре Владимира Даля оно означает «небольшой морской залив, бухта». Если придерживаться этой гипотезы, прозвище получил человек, живший на берегу такого залива. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от названий географических объектов и особенностей местности.

Вторая версия выводит имя Лахта из канонического мужского имени Галактион. Цепочка преобразований здесь выглядит так: Галактион → сокращенная форма Лактион → Лахтион → Лахта. Само имя Галактион греческого происхождения и переводится как «молочный». В этой версии фамилия Лахтюк — отчество, то есть буквально «сын Лахты».

Какая из версий правдоподобнее? География подсказывает, что первая — региональная. Фамилия Лахтюк и её однокоренные варианты (Лахтин, Лахтанов) чаще встречаются на северо-западе России, в бывших новгородских и псковских землях, а также на побережье Финского залива. Именно там слово «лахта» в значении «залив» было в ходу до XIX века (сравните топонимы: Ораниенбаумская Лахта, Лахтинский разлив). В центральных и южных губерниях, где о заливах не говорили, фамилия могла возникнуть только от имени Галактион. Поэтому для конкретного рода Лахтюк значение фамилии зависит от того, откуда родом его предки.

Суффикс -юк в фамилии указывает на её происхождение в западнорусских или украинских землях (наряду с суффиксами -ук, -чук). Это значит, что носитель фамилии — потомок человека, которого в обиходе звали Лахта. В официальных документах прозвище постепенно закрепилось как наследственное имя, вытеснив крестильное. Социальный состав таких семей был разным: от крестьян до мещан и однодворцев, но в основе фамилии лежит либо бытовое прозвище по месту жительства, либо уменьшительная форма церковного имени.