Фамилия Лапонин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Лапонин послужило церковное имя Евлампий или Харлампий. Фамилия Лапонин, вероятно, ведет свое начало от имени Лапоня, которое представляет собой уменьшительную форму нередких в старину имен Евлампий и Харлампий, имеющих греческое происхождение. Имя Евлампий означает «благосветный», а Харлампий - «светящийся радостью». Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Лапонин образована от дохристианского личного имени Лапоня — ласкового обращения к милому, любимому человеку (однокоренными являются «лапа», «лапушка», «лапонька»). О точном месте и времени возникновения фамилии Лапонин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Лапонин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.