Фамилия Лариина — редкий случай, когда суффикс -ин присоединяется к основе, которая сама по себе уже выглядит как окончание женского рода. В большинстве фамилий на -ин основа оканчивается на твердый согласный (Смирнов — Смирн-а, Козин — Коз-а). Здесь же основа «Лари-» перед суффиксом не теряет гласную, а значит, исходное имя или прозвище звучало как Ларя или Лара.

Самая прямая и правдоподобная версия — происхождение от женского имени Лариса. В бытовой, неофициальной речи его часто сокращали до Лара или Ларя. Фамилия Лариина могла означать «дочь (или жена) Лары». Но есть нюанс: фамилии от женских имён в крестьянской среде давали, если мать была вдовой или воспитывала ребёнка одна. В таком случае Лариина — это «Ларина дочь», то есть ребёнок, записанный по матери. Вторая версия, более редкая, — от прозвища Лара, которое могло относиться к человеку со светлыми, «ларовыми» волосами (от диалектного «лар» — белый, светлый). В некоторых говорах «лара» означала и болтливую женщину, но это скорее исключение.

С точки зрения словообразования, фамилия «женская» по форме, но могла принадлежать и мужчине. В русской традиции фамилии на -ин склоняются по падежам, и в мужском варианте она звучала бы как Лариин. Однако закрепилась именно форма Лариина, что указывает на возможное позднее оформление документа, где переписчик мог записать фамилию в женском роде по ошибке или по имени матери.

Географически фамилия встречается редко и в основном в центральных и северных областях России, где суффикс -ин преобладает над -ов. Встречаются варианты написания с одной «и» — Ларина, но это уже другая, более распространённая фамилия от имени Ларион (Иларион). Лариина же с двойной «и» — явный признак происхождения именно от женского имени Лара, а не от мужского Ларион.