Фамилия Латоян — нечастая, и её происхождение почти наверняка связано с армянским языком. В пользу этого говорят типичный для армянских фамилий суффикс -ян (патронимический, означающий «принадлежащий к роду такого-то») и основа Лато-. Если отбросить суффикс, остаётся корень, который может восходить к личному имени или прозвищу.

Самая вероятная версия: основа Лато- происходит от армянского слова «лат» или «лато», что на диалектах означает «широкий», «просторный», либо от глагола со значением «расширять». В таком случае прозвище Лато мог получить человек плотного телосложения, широкоплечий, или же тот, кто жил на открытой, обширной местности. Менее распространённое, но возможное объяснение — связь с тюркским словом «лата» (заплатка, лоскут), которое могло стать прозвищем портного или бедняка, но для армянской среды это менее типично.

Географически фамилия Латоян встречается в основном в Армении и в армянских диаспорах (Россия, Грузия, США). В России её носители сосредоточены в Краснодарском крае, Ростовской области и Москве — регионах традиционного расселения армян. Сословной принадлежности предков по фамилии не определить: -ян — суффикс всесословный, его носили и крестьяне, и ремесленники, и духовенство.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: основа, скорее всего, прозвищная, а не от крестильного имени. В армянской ономастике такие фамилии нередко указывают на физическую характеристику человека — в отличие от фамилий от имён (например, Арутюнян от Арутюн). Поэтому предок первого Латояна был, по всей видимости, заметен статью или широтой души — в прямом или переносном смысле.