Фамилия Латонин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность к роду: «чей?» — Латонин, то есть сын или потомок Латони. Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Латоня. Что могло лежать в его основе?

Самый прямой путь — от слова «латать», то есть чинить, ставить заплаты. Латоней могли прозвать портного, сапожника или любого мастера, который занимался починкой одежды и обуви. В говорах «лата» означала заплату, лоскут, а «латошник» — того, кто шьёт наспех, кое-как. В этом случае фамилия Латонин — типично «ремесленная», как Швецов, Кожевников или Портнов.

Вторая версия, менее очевидная, но тоже возможная: Латоня — уменьшительная форма от крестильного имени Платон. В народном произношении начальное «п» нередко отпадало (сравните Платон и Латоня, как Полина и Лина). Если так, то Латонин — это «внук Платона», и фамилия восходит к личному имени предка. Такое переосмысление встречается часто: например, от имени Кондрат образованы фамилии Кондратов и Кондратьев, а от Лаврентий — Лавров и Лавриков.

Географически фамилия Латонин встречается нечасто. По данным современных телефонных справочников и архивных записей, её носители сосредоточены в центральных областях России — в Тверской, Ярославской, Московской губерниях. Это говорит о том, что фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной, что типично для прозвищ, привязанных к конкретному человеку или его занятию.

Интересная деталь: в отличие от массовых фамилий на -ов, суффикс -ин здесь указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или гласный. Латоня — имя или прозвище именно с таким окончанием, что и определило форму фамилии. Если бы основа звучала как Латон, мы бы имели Латонов, но в реальности закрепился именно Латонин.

Таким образом, перед нами фамилия, которая с равной вероятностью могла принадлежать либо потомку портного-латальщика, либо внуку человека по имени Платон. Обе версии имеют под собой лингвистическое основание, и выбрать одну без дополнительных генеалогических данных сложно.