Основой фамилии Латонина послужило имя Латоня. Именование Латоня может представлять собой уменьшительную форму имени Платон, которое в переводе с греческого означает «широкоплечий». В истории христианства известно два святых покровителя этого имени: преподобный Платон исповедник Студийский (день его памяти приходится на 18 апреля) и мученик Платон (1 декабря). По другой версии фамилия Латонина восходит к украинскому прозвищу Латання, что означает «тот, кто пришивает заплаты» или «тот, кто наказывает поркой». Согласно ещё одной гипотезе, фамилия Латонина имеет семинарское происхождение. Семинарские фамилии возникали в следующих случаях: - когда человек к моменту поступления в семинарию ещё не имел официально закрепившейся фамилии, а её, тем не менее, требовалось указать в документах; - когда естественно сложившаяся фамилия будущего церковнослужителя ассоциировалась с неподобающими сану вещами (например, Пьянов, Любовников, Разгуляев), семинарские наставники рекомендовали сменить её на более подходящую; - когда красивая фамилия, достойная сана священнослужителя и указывающая на его род занятий, присваивалась одаренным ученикам, отличникам в знак поощрения, а фамилия, образованная от слова с негативным значением, - нерадивым ученикам ради наказания. В этом случае в основе фамилии лежит имя мифологического персонажа Латоны - матери Аполлона. Само имя Латона восходит к ликийскому слову lada – «жена», «мать». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Латоня, со временем получил фамилию Латонина.