Фамилия Латыган — редкий случай, когда версия о происхождении почти очевидна, но требует оговорки. Скорее всего, в её основе лежит слово «латыга» или «латыш». В русских говорах, особенно на северо-западе, выходцев из Латвии или людей, говоривших с характерным «латышским» акцентом, могли прозвать «латыгой». Суффикс «-ан» в таких прозвищах выполнял ту же роль, что и в словах «грубиян», «буян» — указывал на человека, обладающего ярко выраженным качеством. То есть Латыган — это «человек, похожий на латыша» или «тот, кто перенял латышские черты». Необязательно по крови: прозвище могли дать за манеру одеваться, за медлительность или, наоборот, за упрямство, которое в народе приписывали прибалтам.

Вторая, менее вероятная версия, отсылает к диалектному слову «латыга» в значении «ветошь, лохмотья» или «неопрятный человек». В этом случае Латыган — тот, кто ходит в рваной одежде. Но здесь стоит учесть географию: фамилия встречается в основном в Псковской, Новгородской и Тверской областях, то есть именно там, где исторически были тесные контакты с балтийскими народами. Поэтому «латышская» версия выглядит весомее.

Сама модель образования — прозвище плюс суффикс «-ан» — архаична. Такие фамилии часто застывали в форме чистого прозвища, без типичных русских суффиксов -ов или -ин. Латыган — это и есть исходное прозвище, которое стало фамилией. В документах XVII–XVIII веков, когда крестьян начали массово записывать для ревизских сказок, такое прозвище могли зафиксировать без изменений, особенно если человек был одинок или жил на отшибе.

Встречаются варианты написания: Латыганов (с добавлением -ов, по аналогии с более привычными фамилиями) и Латыгин. Но «Латыган» — именно та форма, которая сохранила первоначальный звуковой облик. Носителей фамилии немного, и это типичная «гнездовая» фамилия: её концентрация в нескольких районах Псковщины указывает на то, что все современные Латыганы, скорее всего, потомки одного человека, получившего такое прозвище лет триста назад.