Фамилия Лепатова — женская форма фамилии Лепатов, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Модель образования здесь классическая: основа «Леп-» плюс суффикс притяжательности «-ат-» и окончание «-ов». Суффикс «-ат-» в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на прозвище, образованное от глагола или существительного с помощью этой морфемы (сравните: «бородатый» → Бородатов, «горбатый» → Горбатов). То есть Лепатов — это «сын Лепатого», а сам Лепатый — прозвище человека.

Корень «леп-» в русском языке многозначен. Самая прямая версия — от глагола «лепить». Лепатым могли назвать человека, который занимался лепкой, гончарным делом или строительством из глины. В говорах «лепать» означало «лепить, сбивать вместе», а «лепавый» — «ловкий на лепку». Вторая версия, менее очевидная, но имеющая право на существование: от диалектного «лепый» — «красивый, статный». В древнерусском языке «лепый» значило «хороший, красивый» (отсюда «великолепный»). Тогда Лепатый — человек с приятной внешностью или добрый нравом. Третий вариант — отчество от нецерковного имени Леп, которое давали в надежде, что ребёнок вырастет «лепым» (ладным, складным).

Географически фамилия Лепатов тяготеет к южным и центральным областям России — воронежским, тамбовским, саратовским землям. В этих краях слово «лепать» в значении «лепить» было в ходу, что делает ремесленную версию более убедительной, чем книжную «красоту». Социально фамилия однозначно крестьянская или посадская: суффикс «-атов» вместо «-ов» — признак прозвищного происхождения, а не дворянского или духовного сословия.

В написании «Лепатова» есть одна тонкость: ударение. В большинстве говоров оно падает на второй слог — Лепáтова, от прозвища Лепа́тый. Но если корень восходит к «лепый», ударение смещается на первый слог — Лéпатов. В современных справочниках фамилию фиксируют с ударением на «а», что косвенно подтверждает глагольную основу.