Фамилия Лепшина — одна из тех, где географическая привязка оказывается важнее личного прозвища. В основе лежит не имя и не профессия, а название реки Лепша. Это правый приток Моши, протекающий по Карелии и Архангельской области. Человек, живший на её берегах, получал прозвище Лепшин — «с Лепши», а его дети уже записывались как Лепшины.

Само слово «Лепша» имеет финно-угорские корни. Скорее всего, оно восходит к слову «леп», которое в некоторых языках этой группы означает «ольха» или «осина». То есть название реки указывало на характер растительности по её берегам — заросли ольхи. Эта версия выглядит убедительнее, чем попытки вывести фамилию из славянского «лепый» (красивый), поскольку гидронимы в тех краях почти всегда доходят до нас из языка древнего местного населения.

Модель образования типична для северных русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Лепшин). Сначала это было отчество от прозвища, а затем закрепилось как фамилия. Фамилия Лепшина — женская форма, и в этом нет ничего необычного: в русской традиции она просто указывает на женщину из рода Лепшиных.

Географически фамилия должна была встречаться чаще всего в тех же местах, где протекает река Лепша, — в Архангельской области и Карелии. Однако со временем носители разошлись по стране, и сейчас Лепшиных можно встретить в самых разных регионах, хотя исходная точка остаётся прежней — север России.