Фамилия Лепухина — женская форма фамилии Лепухин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. -ин — один из самых распространённых русских суффиксов, указывающий на принадлежность: Лепухин — «сын Лепуха» или «человек из семьи Лепуха». Такая модель типична для прозвищных фамилий, которые в XIV–XVII веках активно вытесняли отчества в быту.

Основа — «лепух». Здесь возможны две версии, и обе имеют право на существование. Первая: диалектное слово «лепух» (или «ляпух») — так в некоторых говорах называли лопух, репейник. Прозвище Лепух могли дать человеку нерасторопному, медлительному или, наоборот, навязчивому, «прилипчивому». Вторая версия связывает фамилию с глаголом «лепить» (ср. «лепёха», «лепёшка»). В этом случае Лепухом могли назвать того, кто занимался лепкой — гончара, пекаря или просто человека с мягкими, округлыми чертами лица. Оба объяснения укладываются в логику русских прозвищ, где внешность, характер или занятие становились основой для фамилии.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России — Псковская, Новгородская, Тверская области. Там слово «лепух» в значении «лопух» фиксируется в диалектных словарях. Встречается она и на Урале, что может быть следствием переселений крестьян в XVII–XVIII веках.

Интересная деталь: в дореволюционных метрических книгах фамилию иногда записывали через «я» — «Ляпухин» или «Ляпухина». Это не ошибка, а отражение живого произношения: «е» в безударной позиции часто переходило в «я» (аканье и яканье). Так что современное написание с «е» — результат более поздней унификации.

Социальный статус носителей фамилии, скорее всего, был крестьянским или мещанским. В списках однодворцев и государственных крестьян XIX века Лепухины встречаются нередко, а вот среди дворянских родов эта фамилия не зафиксирована. Это типичная «прозвищная» фамилия, которая возникла в низших сословиях и закрепилась после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам их предков.