Фамилия Лапухина — это вариант написания более известной фамилии Лопухина. В основе обеих лежит одно прозвище — Лопух. Человека так могли назвать за наивность и простоватость, за то, что его легко обвести вокруг пальца. Но не всё так однозначно: прозвища такого типа часто давали с иронией, и носитель мог быть как раз человеком себе на уме, а прозвище — шутливым отражением его внешности или манеры поведения. Не исключено, что прозвище Лопух мог получить и больной — из-за схожести с большим и широким листом растения.

В исторических документах прозвище фиксируется с XV века: Олкатко Лопуха, крестьянин Михайловского погоста (1495), Лопуха Иванов (1579), Василий Варфоломеевич Лопуха Лаптев (начало XVI века). Разница в написании — Лапухина вместо Лопухина — объясняется просто: в русских говорах звук «о» в безударном положении часто произносился как «а», и это произношение закрепилось на письме. Так что Лапухина — это не ошибка, а живая фонетическая запись фамилии, которая бытует в тех краях, где «акают». Потомок человека по прозвищу Лопух со временем получил фамилию Лапухина.