Фамилия Лихушин образована от прозвища или имени Лихуша — а это слово, в свою очередь, производное от «лихой». Тут сразу развилка: в русских говорах «лихой» означало и «удалой, бойкий, молодецкий», и «злой, недобрый». Первое значение прямое: прозвище Лихуша давали проворному, решительному парню, ухарю и смельчаку. Второе значение — «зло» — породило особый тип имен: охранительные, или обережные. Родители нарекали сына Лихушей в надежде, что злые силы примут его за «своего» и не тронут. Такой обычай был распространён у славян: чем непригляднее имя, тем меньше шансов, что ребёнку навредят.

Суффикс -уш- в основе Лихуш- указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму. Фамилии на -ин стандартно образуются от основ на -а/-я: Лихуша → Лихушин, то есть «сын Лихуши». По модели это типичная «патронимическая» фамилия, каких в России тысячи, но с редкой семантической развилкой.

Спор между «удалой» и «злой» версиями разрешается просто: оба корня сосуществовали, но в фамилиях чаще закреплялся положительный или нейтральный оттенок. Охранительное имя — гипотеза правдоподобная, но для фамилии Лихушин не единственная. В словарях русских прозвищ и фамилий (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) «лихой» в значении «смелый» встречается гораздо чаще, чем в значении «злой». Поэтому вероятнее, что родоначальник Лихушиных был человеком бойким и заметным, а не «оберегаемым» от зла.

География фамилии неширокая: Лихушины встречаются в центральных областях России и в Поволжье. Встречается вариант написания через «и» — Лихушин, а не Лихушинъ, что указывает на позднюю фиксацию в документах, уже после реформы орфографии. Других однокоренных фамилий — Лихунов, Лихов — немало, но Лихушин стоит особняком из-за редкого суффикса -уш-.