Фамилия Лихушина — женская форма фамилии Лихушин. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Лихуша. Оно образовано с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -уш- от прилагательного «лихой». В старину у этого слова был широкий спектр значений: «молодецкий, проворный, удалой, смелый и решительный», а также «щегольской» и «ухарский». Скорее всего, Лихушей называли бравого, бойкого человека, который выделялся характером или поведением.

Однако у основы «лих-» есть и тёмная сторона. Нарицательное «лихо» означало «зло, беда, горе». Отсюда возникла традиция давать детям «охранительные» имена — считалось, что если назвать сына Лихушей, злые силы потеряют к нему интерес и не причинят вреда. Эта версия не менее правдоподобна: на Руси имя Лихуша действительно могло выполнять роль оберега, как имена Некрас, Нелюб или Злоба.

В итоге обе трактовки сходятся в одном: исходное личное имя или прозвище Лихуша закрепилось за человеком, а затем по стандартной модели русского языка дало фамилию на -ин. Притяжательный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Лихушин», то есть сын, потомок Лихуши. Фамилия Лихушина, соответственно, означает «принадлежащая к роду Лихушиных».