Фамилия Лимонаева — женская форма от Лимонаев, и её происхождение не так очевидно, как может показаться. Самое простое и лежащее на поверхности объяснение — связь с лимоном. Однако в русской ономастике редко встречаются прозвища, напрямую образованные от названий экзотических фруктов, которые были редкостью и диковинкой для крестьянской России. Поэтому версия «лимонный человек» (продавец лимонов или любитель кислого) хоть и возможна, но не самая убедительная.

Гораздо интереснее и правдоподобнее версия, уводящая нас к географическим названиям. В русском языке есть фамилии, образованные от рек и озёр: Лимоны, Лиман, Лиманский. Слово «лиман» (от греческого «лимни» — озеро, залив) широко распространено на юге России и Украины — так называют приморские солёные озёра или расширенные устья рек. Житель такого места мог получить прозвище Лимон, а его потомки — фамилию Лимонаевы. Суффикс «-аев» здесь типичен для южнорусских и украинских фамилий (ср. Можаев, Ходаев), что подтверждает эту географическую привязку.

Третья версия, более редкая, но имеющая право на существование, — происхождение от канонического имени или его производной формы. В дохристианской антропонимике встречается имя Лимон (возможно, как вариант имени Филимон, где отпало начальное «фи»). В таком случае Лимонаев — это «сын Лимона», то есть потомок человека, которого звали Лимоном. Эта модель (основа на -а + суффикс -ев) характерна для русских отчеств, превратившихся в фамилии.

Таким образом, Лимонаева — фамилия с несколькими корнями, но наиболее вероятным выглядит её связь с географическим термином «лиман» и южными регионами России. Если ваши предки были родом с Кубани, Дона или Причерноморья, версия с лиманом становится основной. Менее вероятная, но не исключённая — связь с редким именем или прозвищем, связанным с лимоном как диковинным товаром.