Фамилия Лисачкин образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Лисачкин, то есть сын или потомок Лисачки. Основа «Лисачк-» — это уменьшительно-ласкательная форма от прозвища Лис или Лиса. В русской ономастике такие формы с суффиксом -ачк- (сравните: Кузьма — Кузачка, Лис — Лисачка) встречаются нечасто, что делает фамилию заметной на фоне более распространённых Лисицын, Лисов или Лисенков.

Прозвище Лис (или Лиса) на Руси давали не столько за рыжий цвет волос, сколько за хитрость, изворотливость, льстивость или, напротив, за внешнее сходство с животным — узкое лицо, острые черты. В словаре древнерусских прозвищ такие случаи фиксируются с XV века. Уменьшительная форма Лисачка могла относиться к молодому человеку или ребёнку, которого прозвали за те же качества, но в более мягком, почти ласковом ключе.

Географически фамилия Лисачкин тяготеет к центральным и южнорусским областям, особенно к Рязанской, Тамбовской и Воронежской губерниям. В писцовых книгах и ревизских сказках XVIII—XIX веков встречаются крестьяне и однодворцы с этой фамилией — никакого особого сословного статуса у Лисачкиных не было, это фамилия крестьянского или мещанского корня.

Стоит учесть и редкую версию: в некоторых говорах «лисачка» — это не зверь, а название растения (например, лисохвост) или даже прозвище бойкой, вертлявой женщины. Но основная линия — от прозвища Лис — остаётся самой надёжной. Фамилия недвусмысленно указывает на личное качество предка, давшего начало роду.