В основе фамилии Лисафьев лежит имя Лисафья. Лисафья (Олексафия, Алисафа) — это одна из просторечных форм крестильного женского имени София. Имя София в переводе с греческого означает «премудрая». В результате, потомок женщины, обладающей именем Лисафья, со временем получил фамилию Лисафьев.