Фамилия Лисафина — женская форма, мужской вариант — Лисафин. В основе лежит редкое, почти забытое имя или прозвище Лисафан. Разбираем словообразовательную модель: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Лисафин — это «сын Лисафана» или «человек из рода Лисафана». Такая модель типична для русского севера и центральных областей, где отчества и фамилии на -ин образовывали от имён, оканчивающихся на согласный или -а/-я.

Самая вероятная версия происхождения основы — от имени Лисафан, которое является просторечной, народной формой канонического имени Иосафат (в русской традиции через греческое Иоасаф). Имя это пришло из Ветхого Завета, означает «Яхве судил». В простонародье оно переделывалось до неузнаваемости: Иосафат → Исафат → Лисафат → Лисафан. Переход начального «И» в «Ли» — явление нередкое в русской диалектной фонетике (сравните: Ирина → Арина → Лярина, или Илья → Лия). Таким образом, Лисафин — это «внук» или «потомок» человека, которого в быту звали Лисафаном, а по крещению — Иосафатом.

Другая, менее вероятная гипотеза отталкивается от прозвища Лисафан, связанного с диалектным глаголом «лисать» (быстро бегать, удирать) или «лисить» (хитрить). Но в этом случае ожидалась бы форма Лисафин от прозвища Лисафа, а не от Лисафан. Кроме того, прозвищная версия слабее, потому что имя Иосафат, хоть и редкое, в некоторых губерниях (особенно в старообрядческой среде) бытовало, и его народные варианты фиксируются в переписных книгах XVII–XVIII веков.

Географически фамилия Лисафин тяготеет к Поволжью и Уралу. Встречается она в Татарстане, Башкортостане, Удмуртии, а также в Кировской области. Это указывает на позднюю фиксацию фамилии (вторая половина XIX века), когда крестьяне центральных губерний переселялись на восток, и на то, что имя Иосафат сохранялось в среде старообрядцев, которые активно осваивали эти земли. Сословно носители фамилии — почти наверняка государственные или удельные крестьяне, а не дворяне: фамилии на -ин от редких церковных имён в дворянской среде нехарактерны.

Однокоренных фамилий мало: Лисафатов, Лисафанов (от той же основы, но с другим суффиксом) и, возможно, искажённое Лисафьин. Если ваш предок носил фамилию Лисафин, с большой вероятностью он был потомком крестьянина-старообрядца, которого крестили редким ветхозаветным именем Иосафат, а в быту звали Лисафаном.