Фамилия Лисанюк — яркий пример того, как украинская словообразовательная модель «переплавила» польское или белорусское имя в фамилию, понятную на слух. Её основа — мужское имя Лисан, которое в славянской традиции является уменьшительной или разговорной формой от канонического имени Елисей (через форму Елисан) либо от более редкого Елевсий. В польском языке имя Liszan (Лисан) фиксировалось как самостоятельное, и именно оттуда, скорее всего, пришёл корень. Суффикс -юк — типичный для западных и южных регионов Украины (Волынь, Подолье, Галиция) патронимический показатель, отвечающий на вопрос «чей?». Таким образом, Лисанюк буквально означает «сын Лисана» или «потомок Лисана».

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с прозвищем Лиса (от животного). Однако в этом случае ожидалась бы форма Лисюк — более простая и распространённая. Усложнённый вариант Лисанюк указывает на то, что в основе лежало именно полное имя, а не прозвище. Если бы предок был хитрым, как лиса, его бы назвали Лисом или Лисенем, но не Лисаном.

Географически фамилия Лисанюк тяготеет к исторической Волыни и Полесью — современным Ровенской, Житомирской, Хмельницкой областям Украины, а также к приграничным районам Беларуси. В польских метриках XVII–XVIII веков встречаются записи Lisaniuk именно на территории Брестского воеводства. Это позволяет предположить, что фамилия сформировалась в среде православной или униатской шляхты, которая постепенно переходила в крестьянское сословие. Никаких сведений о дворянском гербе или выдающихся исторических носителях фамилии не сохранилось — Лисанюки были, скорее всего, свободными землепашцами или ремесленниками.

Особенность написания — твёрдый знак в старой орфографии (Лисанюкъ) встречается в документах Российской империи, но в современной украинской и русской традиции он не используется. Ударение в фамилии, как правило, падает на последний слог — Лисаню́к, что свойственно большинству фамилий на -юк.