Фамилия Лишанская звучит так, будто её носительница родом из места с названием Лишаны или Лишанка. И это самый вероятный путь её происхождения. Модель на -ский/-ская в женском роде (и -ский в мужском) типична для польской, украинской, белорусской и еврейской ашкеназской традиции. Она указывает либо на принадлежность к дворянскому роду (в польской шляхте), либо, гораздо чаще, на географическое прозвище: человека называли по имени села или местечка, откуда он пришёл.

Географическая привязка здесь конкретная. На карте Украины есть село Лишаны (Лышаны) в Житомирской области, а в Беларуси — деревня Лишаны в Гродненской области. Кроме того, существует гидроним Лишанка — речка в бассейне Днепра. Предок, переехавший в город или другую местность, получал прозвание «Лишанский» (или «з Лишан»), которое затем закрепилось за его потомками. В польском варианте фамилия могла звучать как Liszański.

Менее распространённая, но возможная версия — от прозвища «Лишан» (или «Лишак»). В южнорусских и украинских говорах «лишний» означало «излишний», «сверх меры». Прозвище могли дать третьему, «лишнему» сыну в семье, либо человеку, который оказался не у дел. Однако фамилия с суффиксом -ск- чаще указывает на территорию, а не на личное качество, поэтому топонимическое объяснение выглядит убедительнее.

В отличие от фамилий на -ов/-ин, которые массово закрепились в крестьянской среде, Лишанский/Лишанская — фамилия более поздней и «искусственной» модели. Она могла принадлежать мещанам, духовенству или мелкой шляхте. В дореволюционных метрических книгах её носители встречаются среди жителей Волынской и Киевской губерний, что подтверждает связь с Украиной и Беларусью. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Лиша́нская.