Фамилия Лисихины — нечастый случай, когда за родовым именем стоит не прозвище человека, а конкретное географическое место, причем с задокументированной историей названия. В основе фамилии лежит топоним Лисиха — деревня в Иркутской области. Соответственно, первым носителем фамилии мог быть человек, который переселился оттуда и получил прозвание «лисихинский» или просто «Лисиха» — по месту прежнего жительства. Такая модель образования фамилий (от названия деревни или села) характерна для центральных и северных регионов России, но для Сибири она особенно показательна: в XVIII–XIX веках переселенцам часто давали фамилии по покинутым деревням.

С названием самой Лисихи связана любопытная бытовая легенда. Местные предания утверждают, что в середине XVIII века иркутский купец Яковлев отправился охотиться в глухие леса, чтобы испытать новое ружье. Ему попалась черно-бурая лиса — редкий и дорогой зверь. Место оказалось богатым лисицами, и купец назвал его Лисихой. Позже там выросла деревня. Прямых документальных подтверждений этой истории нет, но она хорошо иллюстрирует народную этимологию: название действительно могли дать по обилию лисиц, а не по фамилии первопоселенца.

Сам фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Лисихин, то есть сын или потомок Лисихи. В русской ономастике такие фамилии (от названий на -иха) встречаются реже, чем от имен или профессий, и часто имеют северное или сибирское происхождение. Если бы прозвище было дано по животному, фамилия выглядела бы как Лисицын или Лисов. Форма Лисиха — это именно женский вариант прозвища или название местности, что и подтверждает топонимическую версию.

Точное время возникновения фамилии Лисихин установить сложно: процесс закрепления фамилий в Сибири шел неравномерно, и многие крестьянские фамилии оформились только к концу XIX века. Однако ясно, что корни фамилии уходят в историю освоения Приангарья, а ее носители — потомки сибирских старожилов, чьи предки когда-то обосновались в Лисихе или рядом с ней.