Фамилия Лисненко — пример того, как за одной словообразовательной моделью может скрываться несколько совершенно разных историй. Суффикс -енко указывает на украинское или южнорусское происхождение: так формировались фамилии, означавшие «сын» или «потомок» человека, которого звали Лиснь. Но вот что стояло за этим прозвищем — вопрос, на который у исследователей есть как минимум три ответа.

Первая и самая конкретная версия отсылает к географии. Прозвище Лиснь могли дать человеку, жившему у озера Лисно в Витебской области Белоруссии. Озеро это, расположенное в бассейне реки Дрысы (притока Западной Двины), издавна славилось рыбой и раками. Если предок носителя фамилии Лисненко родился или промышлял на тех берегах, прозвище по месту жительства — самый прямой путь к фамилии.

Вторая версия уводит в область лексики и характера. Украинский глагол «лисніти» значит «блестеть, сиять, лосниться». В этом случае прозвище Лиснь могло описывать внешность: опрятного, чистоплотного человека, одежда которого буквально лоснилась от ухоженности. Либо, в переносном смысле, — радостного, «сияющего» человека с высокими моральными качествами.

Третий вариант — самый неожиданный и редкий. Белорусское слово «лісьнік» означает паслён, травянистое растение из семейства паслёновых. Если прозвище пошло от него, то основатель рода Лисненко мог быть травником или знахарем, хорошо знавшим свойства растений. Такое прозвище-профессия встречается реже, чем топонимическое или описательное, но оно не менее правдоподобно: в народной среде знахарей часто называли по растению, с которым они работали.

Какая из гипотез верна для конкретной семьи Лисненко — сказать без генеалогического исследования невозможно. Но в любом случае фамилия образована по классической украинской модели от прозвища Лиснь, которое со временем вытеснило исходное личное имя и закрепилось в документах.