В основе фамилии Лисякова — прозвище или мирское имя Лисяк. Разобраться, какое именно значение в него вкладывали, непросто: ономасты предлагают несколько версий, и у каждой есть своя логика.

Самое прямое объяснение — от названия зверя, лисы. На Руси было распространено давать детям «животные» имена: Волк, Медведь, Лиса. Считалось, что таким образом ребёнка «защищают» от злых сил или, наоборот, хотят передать ему качества тотемного животного — в случае с лисой это хитрость, ловкость, сообразительность. Позже это мирское имя могло закрепиться и как прозвище для человека с похожим характером.

Вторая версия связана с диалектным словом «лисый». В некоторых говорах так произносили «лысый». Тогда прозвище Лисяк мог получить человек, не имеющий волос. Однако в тех же говорах «лисый» иногда означало «жёлтый» или даже «рыжеватый» — и тогда прозвище могло указывать на цвет волос или бороды. Получается, что одно и то же слово в разных местностях могло описывать прямо противоположные приметы внешности.

Фамилия образована по типичной русской модели: к основе Лисяк добавили суффикс -ов (в женском роде — -ова), что буквально означает «принадлежащий Лисяку», «из семьи Лисяка». Эта фамилия не относится к числу самых распространённых, но встречается в исторических документах. Например, в записях начала XX века есть сведения о Василии Васильевиче Лисякове, родившемся в 1909 году в селе Старогорностолево Западно-Сибирского края. Эта запись подтверждает, что фамилия бытовала в Сибири, куда часто переселялись крестьяне из центральных и северных губерний России.

Примечательно, что фамилия Лисяков (и Лисякова) стоит в ряду однокоренных — Лисов, Лисицын, Лисьев. Но если Лисицын и Лисов образованы прямо от «лиса» или «лисица», то форма с суффиксом -як (Лисяк) встречается реже и характерна скорее для украинской или южнорусской традиции. Это может указывать на то, что предки носителя фамилии происходили из областей, где были распространены такие суффиксальные прозвища.