Фамилия Лобеко — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с внешностью, а с речью или характером. В её корне — глагол «лобекать», который в русских говорах означал «лепетать, говорить невнятно, бормотать». Человека, который мямлил, говорил с запинкой или неразборчиво, могли прозвать Лобека. От этого прозвища и образовалась фамилия с помощью типичного для украинской и белорусской ономастики суффикса -о. Такая модель (Лобек-о) характерна для восточнославянских фамилий, особенно распространённых на землях современной Украины и юга Беларуси, где прозвища часто закреплялись без дополнительных патронимических суффиксов -ович, -енко или -ов.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным словом «лоб» в значении «отлогий холм, крутой берег». Тогда Лобеко мог получить человек, живший на возвышенности. Но эта гипотеза слабее: прозвища от рельефа обычно давали в форме Лобов или Лобан, а суффикс -еко в таком значении почти не встречается.

По суффиксу можно определить и вероятную географию. Фамилии на -еко (как Лобеко, Гузеко, Шепелёко) характерны для запада Украины и юго-востока Беларуси, особенно для исторических регионов Волыни и Полесья. Там прозвищные фамилии без дополнительных формантов — обычное дело, в отличие от центральной России, где преобладают фамилии на -ов и -ин.

Сословной принадлежности у Лобеко, скорее всего, не было: фамилия происходит из крестьянской или казачьей среды, где прозвища фиксировали за человеком его манеру говорить или поведения. В дворянские роды такие фамилии попадали редко.

В современной России и Украине фамилия Лобеко остаётся малочисленной, но встречается стабильно, особенно в южных областях. Носители могут слышать в ней намёк на неспешность или мягкость речи предка — именно эту черту слово «лобекать» и обозначало в народе.