Фамилия Лобойко образована от прозвища Лобой. В старину так называли не только человека с большим лбом, но и вообще крупного, крепкого мужчину. В основе прозвища — слово «лоб» в значении «физическая сила» или «выдающаяся внешность». Украинский суффикс -ойко (уменьшительно-усилительный) указывает на южнорусское или малороссийское происхождение фамилии: такие модели типичны для Черниговщины, Полтавщины и соседних областей. Со временем прозвище Лобой, которое сначала добавляли к имени, полностью вытеснило его в быту и документах. Фамилия Лобойко не имеет отношения к дворянским родам — её носили крестьяне, казаки и мещане. Встречается она в основном на Украине и в южных регионах России, что подтверждает её региональную привязку. Альтернативная версия, связывающая фамилию с литовским или балтским корнем, маловероятна: слово «лоб» и его производные хорошо прослеживаются в восточнославянской лексике.