Фамилия Логунцев — из тех, что на первый взгляд кажутся простыми, но при разборе открывают неожиданный путь: от латинского слова через греческую и славянскую традицию до русского суффикса. Основа здесь — мужское крестильное имя Лонгин, которое восходит к латинскому longus — «длинный, долгий, высокий». Однако в фамилию легла не полная форма имени, а его украинская уменьшительная версия — Логунец. Именно этот вариант, с характерным суффиксом -ец, и стал прозвищем родоначальника.

Словообразовательная модель типична для восточнославянских фамилий: к основе Логунец прибавили патронимический суффикс -ев, который в русской традиции указывает на принадлежность: «чей?» — Логунцев, то есть сын или потомок Логунца. Суффикс -ев здесь закономерен, так как основа оканчивается на мягкий согласный (ц), а не на твёрдый, где было бы -ов.

Важно, что имя Лонгин в православной традиции не было редким. У него семь святых покровителей, и среди них — преподобный Лонгин Коряжемский (память 23 февраля), преподобный Лонгин Яренгский (16 июля) и мученик Лонгин Мелитинский (20 ноября). Такое количество небесных заступников делало имя востребованным в разных слоях населения, хотя в народной среде оно часто упрощалось до более привычных форм — вроде Логуна или Логунца.

Региональная привязка фамилии — южнорусские и украинские земли. Уменьшительная форма Логунец характерна именно для украинской ономастики, где суффикс -ец активно использовался для образования ласкательных или обиходных вариантов имён. Поэтому предки Логунцевых, скорее всего, происходили из малороссийских губерний или пограничья, откуда фамилия позже распространилась шире.

В отличие от фамилий, образованных от прозвищ по профессии или внешности, Логунцев — чисто именной тип, без дополнительного смыслового слоя. Потомок человека, которого в быту звали Логунец, со временем закрепил это семейное прозвание в документах, и оно превратилось в наследственную фамилию. Никакой связи с «логом», «лугом» или глаголом «логать» здесь нет — корень исключительно антропонимический.