Фамилия Логунцов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Логунцов послужило церковное имя Лонгин. Фамилия Логунцов восходит к именованию Логунец. Логунцом, очевидно, прозвали сына человека по имени Логун, то есть маленького Логуна (суффикс -ец может иметь уменьшительное значение). Само имя Логун является просторечной формой имени Лонгин (или Логгин). Это имя восходит к римскому слову longus, что значит «длинный» (в переносном значении - «высокий»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Логун, со временем получил фамилию Логунцов. О точном месте и времени возникновения фамилии Логунцов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Логунцов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.