Фамилия Лончинський образована по типичной для украинской ономастики модели: к основе прозвища Лончин добавили суффикс -ськ(ий), который изначально указывал на принадлежность к местности или роду (сравните: Львівський — из Львова, Ковальський — сын кузнеца). То есть Лончинський — это буквально «тот, кто происходит от Лончина» или «из рода Лончинов».

В основе прозвища Лончин лежит украинское слово «лончак» — так называли годовалое животное, чаще всего медведя или оленя. В народной речи «лончак» подчёркивал не возраст как таковой, а уже набранную силу и размер зверя, который пережил первую зиму. Человек, получивший прозвище Лончин, скорее всего, с детства выделялся физической мощью — его могли сравнить с молодым, но уже крепким медведем. В украинских говорах встречаются и другие фамилии того же корня: Лончак, Лонченко, Лончук, но Лончинський — более поздняя форма, закрепившаяся как наследственное имя.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам Украины — Волыни, Подолью, Галичине, где суффикс -ський в фамилиях встречается особенно часто. В польском языке есть схожая фамилия Łączyński, но её основа иная (от слова łąka — «луг»), так что путать их не стоит: Лончинський — украинская фамилия с прозвищным, а не топонимическим происхождением.

Со временем прозвище Лончин, которое сначала добавляли к крестильному имени, полностью вытеснило его в быту и в документах. Фамилия Лончинський зафиксирована в метрических книгах и ревизских сказках XIX века, но широкого распространения не получила — это редкая фамилия, что делает её особенно ценной для семейной истории.