Фамилия Лопатухина образована от прозвища Лопатуха, которое, вероятно, восходит к топониму Лопатуха. Села с таким названием встречаются в Псковской и Новгородской областях. Согласно другой версии, прозвище Лопатуха восходит к нарицательному «лопата». В этом случае можно предположить, что так прозвали землекопа или огородника. Тогда прозвище относится к числу так называемых «профессиональных» именований, указывавших на род деятельности предка. Веселовского встречаются родственные фамилии: Никита Прокофьевич Лопата Хитрово, 1562 год; московские помещики Юрий и Михаил Матвеевичи Лопатины, 1550 год; князь Дмитрий Петрович Лопата Пожарский, 1641 год; посадский человек Лопаткин Мокий, 1625 год и др.