Фамилия Лопушек — редкий случай, когда мы слышим почти ту же форму, что и в основе. Она образована напрямую от прозвища или нецерковного имени Лопушек. В русской ономастике такие фамилии, совпадающие с исходным словом без наращения суффикса, встречаются нечасто и обычно указывают на прямое прозвищное происхождение. Человека могли прозвать Лопушком за сходство с растением — за мягкость, доверчивость, а может, за наивность или простодушие. Лопух в народной традиции — символ не только навязчивости, но и простоты: «лопух» в переносном смысле означает простака, которого легко обмануть.

Словообразовательная модель здесь проще, чем у большинства русских фамилий. Нет типичного суффикса -ов или -ин, которые превращают прозвище в фамилию. Лопушек — это чистая основа, уменьшительно-ласкательная форма от «лопух». Такая модель встречается у прозвищных фамилий, которые закрепились в документах именно в той форме, в какой человека называли в быту. Сравните с фамилиями Корешок, Петушок, Сверчок — все они образованы без дополнительных патронимических суффиксов.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где слово «лопух» и его производные особенно употребительны. В северных регионах чаще использовали «репей» или «репейник», так что Лопушек — маркер определённой диалектной зоны. Встречается она редко, что неудивительно: прозвища, связанные с растениями, обычно давали не по внешности, а по характеру, и далеко не каждое такое прозвище переходило в фамилию.

В дореволюционных переписях фамилия могла записываться по-разному: Лопушек, Лопушок, Лопушко — в зависимости от местного произношения и грамотности писаря. Вариант с окончанием -ек указывает на мягкость произношения, свойственную некоторым говорам. Если искать однокоренные фамилии, то рядом стоят Лопухин, Лопухов, Лопушанский — все они образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Лопушек стоит особняком как самая короткая и прямая форма, почти не изменившаяся за столетия.