Фамилия Лотошин — редкий пример, где суффикс указывает на географию точнее, чем корень. Она образована по модели, типичной для западнорусских и белорусских земель: основа + суффикс -ин. В отличие от массовых -ов/-ев, этот суффикс в прозвищных фамилиях встречается реже и часто выдаёт носителя из регионов, где смешались русские, белорусские и польские влияния — Смоленщина, Брянщина, Витебщина.

Корень «лотош-» восходит к слову «лоток» или «лотошить». В словарях русских говоров «лотошить» означает «говорить без умолку, тараторить, болтать вздор». Человек с таким прозвищем — Лотоша — скорее всего, был говорлив, суетлив или работал с лотком: разносил товар на рынке. Вторая версия менее вероятна, но возможна: в псковских и тверских говорах «лотоха» — это неряха, растрёпа. Тогда прозвище носило бытовой, насмешливый оттенок.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Лотохов, Лотошников, Лотошинский — показывает, что Лотошин, скорее всего, не «сын лоточника» (там был бы суффикс -ов или -ник), а «сын Лотоши». То есть в основе лежало личное прозвище, а не профессия. Это делает фамилию более древней: такие «именные» формы часто фиксировались уже в XV–XVI веках, когда прозвище ещё не успело превратиться в фамилию ремесла.

Географическая привязка подкрепляется и топонимами: в Тверской области есть деревня Лотошино, а в Московской — посёлок Лотошино (районный центр). Фамилия Лотошин могла возникнуть от названия такого места, но тогда логичнее было бы «Лотошинский» или «Лотошинов». Прямая связь «от прозвища» всё же убедительнее.

Носителей фамилии немного, и в дореволюционных списках она не встречается среди дворянских родов — это крестьянская или мещанская фамилия. В современной России она рассеяна, но заметна в Тверской, Псковской и Московской областях, что совпадает с ареалом слова «лотошить».