Фамилия Лукерьин образована от женского имени Лукерья — это русская народная форма канонического имени Гликерия. В переводе с греческого оно означает «сладкая». В святцах имя соотносится со святой мученицей Гликерией, пострадавшей за веру в III веке; день её памяти приходится на 4 ноября. В быту имя Гликерия оказалось слишком длинным и книжным, поэтому в разговорной речи его упростили до Лукерьи — так появилась основа для фамилии.

Модель образования Лукерьин типична для русских фамилий: суффикс -ин присоединяли к основам на -а/-я. Этот суффикс указывал на принадлежность: «чей?» — «сын Лукерьи» или «человек из семьи Лукерьи». Обычно такие фамилии давали по матери, если женщина играла заметную роль в доме или была вдовой, реже — если имя отца звучало неблагозвучно или выходило из употребления. В случае с Лукерьиным фамилия однозначно отсылает к женскому имени, что встречается реже, чем фамилии от мужских имён.

Сама Лукерья — имя нередкое в крестьянской и мещанской среде XIX века. Оно встречается в метрических книгах Центральной России и Поволжья, где женские имена в форме фамилий давали детям, если мать была единственной кормилицей или её личность в общине перевешивала отцовскую. Географически фамилия Лукерьин тяготеет к регионам, где имя Лукерья было особенно популярно: Владимирская, Костромская, Нижегородская губернии. В современных справочниках фамилия фиксируется как редкая.

Стоит различать Лукерьина и однокоренные фамилии: Лукерьев — от той же основы, но с патронимическим суффиксом -ев, и Лукерьинский — с более поздним, «дворянским» суффиксом -ский. Последний мог возникнуть в семинарской среде, где искусственно облагораживали простонародные фамилии.

Известная носительница исходного имени — Гликерия Николаевна Федотова, артистка Московского императорского театра. Она исполняла роли молодых героинь в пьесах Островского («Гроза», «Бесприданница», «Лес») и других драматургов, став любимицей публики. Однако к самой фамилии Лукерьин эта артистка прямого отношения не имеет — её пример лишь показывает, что имя Гликерия (Лукерья) было в ходу даже в образованных кругах.

Таким образом, фамилия Лукерьин — это отчество по матери, закрепившееся в русской деревне в XVIII–XIX веках. Её носители, скорее всего, потомки крестьян или мещан, где женщину по имени Лукерья уважали или помнили как основательницу рода.