Фамилия Лукиша образована от производной формы крестильного имени Лука. В латинском языке это имя означает «светоносный». В русской ономастике фамилии на -иша встречаются редко, что сразу выделяет Лукишу среди более распространённых Лукиных, Лукичёвых или Лукашовых. Суффикс -иша в данном случае — не уменьшительно-ласкательный, а скорее разговорно-просторечный, характерный для украинской и южнорусской традиции. Он мог прикрепляться к имени в бытовом общении: Лука превращался в Лукишу, а затем это прозвище закреплялось за потомками как фамилия.

Скорее всего, основатель рода Лукиши был человеком из простого сословия. В крестьянской и мещанской среде такие «домашние» формы имени нередко становились фамилиями без дополнительных патронимических суффиксов. Имя Лука в христианской традиции связано с евангелистом Лукой, который, по преданию, был сподвижником апостола Павла и написал первую икону Пресвятой Богородицы. За это его почитали первым иконописцем, а его авторству приписывали множество образов Богородицы, в том числе Владимирскую «Богоматерь». Однако фамилия Лукиша не несёт прямого указания на церковную или иконописную профессию — она лишь указывает на то, что предка звали Лукой, причём в обиходной, «своей» форме.