Фамилия Лукойнов — редкий случай, когда церковное имя превратилось в прозвище, а затем в фамилию, сохранив при этом необычную форму. В основе лежит имя Лука. Казалось бы, чего проще: Лука → Лукин. Но здесь сработала другая модель. В русских говорах, особенно на севере и в Поволжье, бытовала уменьшительно-пренебрежительная форма Лукойня (от Лука + суффикс -ойня, как Ванька → Ванюха, Ванюня). Человека, которого в миру звали Лукойней, в документах могли записать как «Лукойнов сын» — то есть сын Лукойни. Со временем притяжательное прилагательное застыло в фамилии.

Суффикс -ов указывает на патроним (отчество), но не от канонического Лука, а от его просторечного производного. Такая словообразовательная цепочка характерна для фамилий, которые возникли в крестьянской или посадской среде, где церковное имя редко употреблялось в полной форме. В переписных книгах XVI–XVII веков можно встретить имена Лукаш, Луканя, Лутоня — все от Луки, но Лукойня стоит особняком благодаря редкому суффиксу -ойн-.

Вторая, менее вероятная версия отталкивается от прозвища Лукойня, которое могли дать человеку с характерной походкой (лукать — кидать, бросать, отсюда «лукойный» — тот, кто разбрасывает вещи или ходит вразвалку, словно «кидает» ноги). Но здесь нет надежных диалектных подтверждений, и большинство ономастов склоняются к именной основе.

Географически фамилия тяготеет к Нижегородской области и прилегающим районам — там, где имя Лука было особенно популярно и где сохранились архаичные суффиксы. Встречается также в мордовских и чувашских селах, куда фамилия попала вместе с русскими переселенцами.

Носителям фамилии стоит знать: их предки почти наверняка не были дворянами. Лукойновы — типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия, возникшая в XVI–XVII веках в среде, где имя Лука произносили по-свойски, с деревенской теплотой и без оглядки на церковный устав.