Фамилия Лукутин — один из примеров того, как в русской ономастике народная форма имени превратилась в устойчивое родовое прозвание. В основе лежит мужское крестильное имя Лука. С латинского оно переводится как «светоносный», и его носил евангелист, автор одного из четырех Евангелий и Деяний святых Апостолов. Однако фамилия образовалась не от полной церковной формы, а от её обиходного, уменьшительного варианта — Лукута. Такое словообразование типично для простонародной среды XVII–XVIII веков, где имя могли сокращать и смягчать на бытовой лад: Лука превращался в Лукуту, а его сын или внук записывался как Лукутин («чей?» — из рода Лукуты).

Притяжательный суффикс -ин указывает на принадлежность: Лукутин буквально означает «сын Лукуты». Эта модель характерна для фамилий, образованных от имен и прозвищ на -а/-я (ср. Ильин, Фомин, Кузьмин). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще давали по отцу с твердым окончанием имени, -ин закреплялся за основами на мягкий или гласный звук. Поэтому Лукутин — не исключение, а закономерный результат адаптации греко-латинского имени в русском быту.

Интересно, что в некоторых говорах слово «лукута» могло иметь и нарицательное значение — так иногда называли извилистую речку или излучину, но для фамилии эта версия менее вероятна. Основной и подтвержденный путь — от имени Лука через форму Лукута. Потомок человека, которого в миру звали именно так, а не полным церковным именем, со временем и получил фамилию Лукутин. Географически фамилия встречается преимущественно в центральных и северных регионах России, где уменьшительные формы на -ута были особенно распространены.