Фамилия Лундэ — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано со славянскими корнями. В русском языке нет слова «лундэ» или «лунда», которое могло бы стать прозвищем. Поэтому первое, что приходит в голову специалисту, — искать основу в языках финно-угорской группы, а именно в карельском или финском.

Самая вероятная версия: фамилия восходит к финскому слову lunde или его диалектным вариантам. В прибалтийско-финских языках «лунде» (lunde) может означать «снегирь» или, в переносном смысле, «миловидный, пригожий человек». В карельском языке есть слово lundu — «птица». Таким образом, прозвище Лундэ могли дать либо человеку с яркой внешностью (как снегирь), либо птицелову, либо просто тому, кто был лёгок и быстр, как птица. Такие прозвища были распространены на северо-западе России, в Карелии и бывшей Олонецкой губернии, где русское население веками соседствовало с финно-уграми.

Менее вероятная, но возможная версия — немецкое или скандинавское происхождение. В немецком языке есть фамилия Lunde, которая иногда связывается с топонимом (например, город Лунд в Швеции). Однако для русской фамилии Лундэ это менее типично: немецкие фамилии чаще оканчивались на -е, а не на -э, и входили в русский обиход через остзейских немцев. Форма с буквой «э» на конце — скорее графическая особенность, закрепившаяся при записи финского слова русскими писарями.

Суффикса в фамилии нет — она представляет собой чистую основу, что характерно для поздних прозвищных фамилий, которые не проходили через стандартную модель с -ов или -ин. Такие фамилии чаще встречались у крестьян и мещан северных губерний, где приходские священники или чиновники записывали прозвище «как слышали», не русифицируя его.

Фамилия Лундэ — не «русская» в классическом понимании, а местная, северная. Её носители, скорее всего, выходцы из Карелии или Архангельской губернии, и предки могли быть крестьянами, рыбаками или охотниками, получившими прозвище от соседей-карелов за какую-то птичью черту характера или внешности.