Фамилия Лунякин образована от прозвища Луняка, в основе которого лежит название птицы «лунь» (хищная птица семейства ястребиных с серовато-белым оперением у самца). Возможно также, что этимология прозвища Луняка связана с диалектным глаголом «лунуть», который в новгородских и сибирских говорах означает «выстрелить, хлопнуть». Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, эта фамилия происходит от имени Луняка — уменьшительной формы мужских имен Лука, Лукьян. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Луняка, со временем получил фамилию Лунякин.