Фамилия Лупинога — редкий пример шутливого прозвища, которое закрепилось за человеком и перешло в наследственное имя. В её основе лежит повелительное наклонение глагола «лупить» (в древнерусском — «бить, сечь» или «жадно, неумеренно есть») и существительное «нога». Такая конструкция — глагол в форме приказа плюс объект — характерна для старых русских прозвищ, которые давали за манеру поведения или внешнюю особенность.

Прозвища, образованные от названий частей тела, в Древней Руси встречались часто, но форма «Лупинога» выделяется именно глагольным началом. Она придаёт имени оттенок действия: «лупи ногу» — то ли команда, то ли насмешливое описание человека, который постоянно на ногах, суетится или бьёт ногами. Скорее всего, так прозвали ловкача, удальца, непоседливого и суетливого человека — того, кто не сидит на месте и всех вокруг «лупит» своей активностью.

В отличие от более распространённых фамилий на -ов или -ин, фамилия Лупинога сохранила исходную прозвищную форму без патронимического суффикса. Это указывает на то, что прозвище закрепилось как родовое имя напрямую, вероятно, на севере или в центральных говорах, где такие «глагольные» фамилии встречаются чаще. Сравните с однокоренными Лупин, Лупанов — здесь суффикс уже переводит прозвище в отчество, а Лупинога остаётся более архаичной и прямой.

Ономастический словарь Б. Унбегауна относит подобные модели к разряду «прозвищных фамилий», которые нередко возникали в крестьянской или посадской среде. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это верный признак того, что предки Лупиноги были простыми людьми: крестьянами, ремесленниками или служилыми людьми «по прибору». В переписных книгах XVII–XVIII веков подобные фамилии встречаются спорадически, но целенаправленный поиск по архивам мог бы уточнить географию — скорее всего, это северные или вологодские земли, где сохранилось много диалектных прозвищ.