Фамилия Луптова — женская форма фамилии Луптов, и её происхождение стоит искать в мужском варианте. Сама фамилия Луптов относится к типичным русским фамилиям на -ов, образованным от прозвища или имени. Основа здесь — «Лупт» или «Лупа».

Самая вероятная версия: в основе лежит прозвище Лупа, Луп, которое в русских говорах имело несколько значений. В северных и сибирских диалектах «лупа» — это шелуха, скорлупа, кожура, а также нечто отставшее, отслоившееся. Прозвище могли дать человеку неопрятному, небрежному, или, наоборот, скупому — «облупленному», бедному. Второе, более редкое значение — «лупить» в смысле «бить, колотить»; тогда Лупой называли драчуна или человека с тяжёлой рукой.

Версия с каноническим именем маловероятна. В святцах есть имя Лупп (римский мученик II века), но от него образуются фамилии Луппов, Луппин, а не Луптов. Форма «Луптов» указывает на основу «Лупт», которая могла возникнуть из диалектного произношения: в некоторых говорах имя Луппа произносили с твёрдым окончанием «Лупт», и от этой усечённой формы и пошла фамилия. Это редкий, но возможный путь.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Луптов — сын Лупа или Лупты. Встречаемость фамилии крайне низкая, она локализована в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях, где диалектное слово «лупа» было в ходу. Судя по географии, предки Луптовых были скорее крестьянами или посадскими людьми, а фамилия закрепилась за одной ветвью рода, не получив широкого распространения.

Интересная деталь: фамилия Луптова — одна из тех, где написание не совпадает с привычным звучанием. В бытовой речи её часто произносят как «Лупто́ва» с ударением на второй слог, но по правилам русских фамилий на -ов ударение чаще падает на основу: «Лу́птова». Однако точное ударение можно узнать только от самих носителей — в разных семьях оно могло закрепиться по-своему.