Фамилия Луппова образована от полной формы мужского имени Лупп, что указывает на её происхождение из среды, где церковные имена давались по полному канону. Имя Лупп имеет латинские корни и означает «волк». В православной традиции известен один святой с таким именем — мученик Лупп Солунский, раб великомученика Димитрия Солунского. Согласно житию, после казни господина Лупп взял его ризу, орошённую кровью, и перстень — этими святынями он сотворил много чудес. Почитание святого Луппа было достаточно широким, однако само имя в народной среде встречалось редко, что делает фамилию Лупповых скорее книжной, а не обиходной.

Поскольку имя Лупп не относилось к числу распространённых, его носители, вероятнее всего, были людьми грамотными или принадлежали к привилегированным сословиям — духовенству или служилым людям, где строже следили за соответствием имени святцам. Фамилия образована по стандартной патронимической модели с суффиксом -ов, что значит «потомок Луппа».

Существует и альтернативная версия, связывающая фамилию не с крестильным именем, а с прозвищем Лупп, образованным от корня «луп-» (лупить, обдирать). В этом случае прозвище могло указывать на буйный нрав, драчливость или, напротив, на крепкое телосложение и хороший аппетит. Однако эта гипотеза менее правдоподобна: фамилия Луппов (и её женская форма Луппова) встречается в документах в основном в северных и центральных губерниях, где имя Лупп фиксируется в церковных записях, тогда как прозвищная версия не имеет устойчивой региональной привязки. Таким образом, основным источником фамилии остаётся редкое календарное имя, а её носители — потомки людей, носивших это имя по святцам.