Фамилия Лымаренко образована от прозвища Лымарь, а оно, в свою очередь, восходит к украинскому слову «лимар» — шорник, то есть мастер по изготовлению конской упряжи. Это профессиональное прозвище: предок, скорее всего, работал с кожей, шил сёдла, уздечки и хомуты. Суффикс -енко в фамилии типичен для украинской антропонимии и означает «сын» или «потомок»: Лымаренко — буквально «сын Лымаря».

Есть и вторая, менее вероятная версия. В пермских говорах слово «лымарь» означало рослого, видного человека. Если это так, то прозвище могло характеризовать не ремесло, а внешность предка. Однако основная и самая надёжная гипотеза — профессиональная: фамилии шорников и кожевников встречаются повсеместно, и украинский суффикс -енко плотно связан именно с этой моделью.

Фамилия Лымаренко распространена на юге России и в восточной Украине, в тех регионах, где конное дело и кожевенное ремесло были особенно развиты. Интересно, что в одних и тех же сёлах рядом с Лымаренко часто встречаются Лымарь, Лымарев и Лымаренков — все они восходят к одному корню, но различаются по способу оформления (суффиксы и окончания). Это говорит о том, что прозвище было живым и продуктивным, а разные ветви одного рода могли закрепить его в документах по-разному.